Основной пигмент, который определяет цвет волос, оттенок кожи и цвет глаз любого человека — меланин. Его концентрация оказывает основополагающее влияние на окраску радужной оболочки глаза человека: чем больше меланина — тем темнее глаза. Так, у кареглазых людей наблюдается максимальная концентрация пигмента, а у голубоглазых — минимальная. В незначительной степени цвет глаз определяется концентрацией волокон самой радужной оболочки. Здесь также наблюдается прямая зависимость: чем больше концентрация — тем темнее глаза.
Красные глаза альбиносов характеризуются полным отсутствием пигмента, вследствие чего становятся видны кровеносные сосуды, содержащиеся в радужке.
На количество пигмента в клетках влияет наследственный фактор. Темный цвет — доминантный признак, а светлый — рецессивный. В мире наибольшее количество людей обладает карими глазами, а наиболее редко встречаются зеленоглазые представители человеческой расы, их всего 2% от всего населения планеты. Согласно физиологическим о