Свой первый массированный налёт на Воронеж вражеская авиация совершила 28 июня 1942 года. Это был ночной налёт. Силы противостоящих сторон были неравные - 101-я ИАД ПВО имела в строю всего 47 самолётов. Однако, противник потерял три машины.
День первого июля сорок второго года был особенно жарким. Фронт приблизился, воздушные тревоги участились. Младший лейтенант Колесниченко разговаривал с командиром звена, когда в полдень с юга неожиданно появилась большая группа вражеских бомбардировщиков. Они прорывались к механическому заводу. Прозвучал сигнал боевой тревоги.
Василий быстро вскочил в самолёт и первым поднялся в воздух. Он направил машину наперерез тяжёлым "хейнкелям", стараясь не дать им возможности сбросить бомбы на механический завод. Вдруг он ощутил сильную боль в ногах. Это незаметно подкравшийся сверху "мессер" пустил длинную пулемётную очередь, которая прошлась по ногам Василия и зажгла его истребитель. По плоскости крыльев потянулись серо-чёрные полоски дыма, а затем выплеснулся огонь.
Тогда, чётко осознавая ситуацию, младший лейтенант Колесниченко направил свой горящий самолёт на лидера немецких бомбардировщиков и таранил его. Потом неимоверным усилием Василию удалось на какой-то миг выровнять машину, но огонь уже подобрался к кабине. Теряя сознание, Колесниченко с трудом отстегнул привязные ремни и выбросился с парашютом...
Подобрали его у Дона и на санитарной машине быстро доставили в хирургическое отделение областной клинической больницы. Десять часов врачи боролись за жизнь героя. Не приходя в сознание, Василий умер от сильных ожогов. Похоронили его у больницы на братском кладбище, а впоследствии останки лётчика перенесли в братскую могилу в парке областной станции юннатов.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 14 февраля 1943 года Василий Ефремович Колесниченко первым из защитников Воронежа был удостоен высокого звания Героя Советского Союза (посмертно). В 1975 году улица Бессарабская в Ленинском районе Воронежа, которая проходит недалеко от механического завода, была переименована в улицу лётчика Колесниченко.