Реакторы малой мощности существенно более безопасны в отношении катастрофических аварий. Среди таких аварий рассматриваются два типа. Первый. Реактивностная авария, в результате которой идет неконтролируемый рост мощности, что приводит к полному разрушению конструкций. Для того, чтобы произошла такая авария необходимо, чтобы в реакторе был большой запас реактивности, который может быть активно задействован в нейтронном балансе. Но сделать это довольно сложно. Обычно в реакторах малой мощности избыток реактивности подавляется за счет размещения в активной зоне выгорающих поглотителей. При изготовлении тепловыделяющих элементов непосредственно в топливо помещают выгорающий поглотитель таким образом, что извлечь его нельзя. В дополнении к этому, конечно, жесткое требование относительно коэффициентов реактивности, которые обеспечивают мгновенное подавление любого рода возмущений и возвращают реактор в номинальное состояние. Вторая авария более неприятна. Она связанна с потерей теплоотвода от активной зоны. В реакторах большой мощности такая авария ведет к расплавлению активной зоны. Это то, что было на Фукусиме. От реактора больших размеров отвести тепло трудно, поскольку остается всего два механизма транспорта тепла – теплопроводность и лучистое излучение. Можно, конечно, рассчитывать на естественную циркуляцию, но гарантированно предсказать какие тракты естественной циркуляции появятся в результате аварии сложно. В реакторах малой мощности удельное энерговыделение меньше, и поэтому отвод остаточного тепла можно организовать без разрушения твэлов.
Разные исследователи в мире изучали надежность и безопасность реакторов малой мощности. Общее заключение звучит так: «Снижение мощности на порядок по отношению к современным реакторам мощностью в 1000 МВт (эл), повышает безопасность, как минимум, на порядок.»
Наибольшие возражения в отношении реакторов малой и среднее мощности - экономика.