В конце XIX века в Кронштадте, было решено построить Морской собор, который стал бы достойным памятником морякам, погибшим на Российском флоте. Свято-Никольский собор в Кронштадте сооружался Морским ведомством и поэтому получил название Морского собора. Для строительства была выбрана центральная площадь города, где хранились вышедшие из употребления якоря, поэтому она получила название Якорной.
Председателем Строительного комитета стал вице-адмирал С. О. Макаров. Работы по расчистке и подготовки территории производились моряками флотских экипажей и учебных отрядов. За период 1903-1907 годов были выполнены все общестроительные работы, что для сооружения столь больших размеров было необыкновенно быстро.
с 1908-го года, когда была введена в строй система отопления, работы внутри стали вести круглый год. Роспись стен и сводов, мозаики в главном портале выполнены по оригиналам М.М. Васильева, иконы - А.В. Троицкого, Ковры жены моряков вышивали шерстью сами. Весь собор внутри был освещен 5-ю тысячами электрических лампочек.
10 июня 1913 г. состоялось торжественное освящение Морского собора во имя Святителя Николая Чудотворца. В плане собор повторяет храм св. Софии в Константинополе с несколько измененными пропорциями. Длина здания - 83,2 м, ширина - 64 м, высота с крестом - 70,6 м, диаметр купола который виден на многи километры - 26,7 м.
Снаружи собор облицован серо-желтым кирпичом. Над северными воротами поместили образ Божьей Матери, над южными - образ святителя Митрофания, над западными - св. Апостолов Петра и Павла, святителя Николая Чудотворца и св. Ионна Рыльского. Крыши покрыли медью и украсили золочеными крестами и орнаментами.
В октябре 2002 года состоялось повторное освящение собора и установка креста над главным куполом. В 2013 г. завершилась реставрация. Купол Морского собора в Кронштадте хорошо виден с противоположных берегов Финского залива. И от Петергофа, и от Сестрорецка.