Тибетская медицина, как система, начала складываться, примерно в 7 веке нашей эры. В ее основе лежат основные философские и мировоззренческие позиции буддизма.
В 1795 году в Лхасе Регент «Пятого Великого» Далай-ламы деси Сангье Гьянцо основал медицинскую школу Чакпори. В «Четырех тантрах» (7 век) основные постулаты индийской медицины адаптированы к тибетской реальности.
Аюрведа (индийская медицинская система) лежит в основе физиологии и психопатологии, изложенной в «Четырех тантрах».
Согласно данному учению, основные жизненные функции поддерживаются благодаря трем системам (желчи, ветре и слизи), регулирующим состояние организма на уровне структур, формируемых семью органическими тканями: хилусом, кровью, кожей, жировой тканью, костями, костным мозгом и репродуктивными жидкостями (сперма или менструальная кровь). В Калачакратантре система каналов, по которым текут жидкости и жидкие тела, является главным объектом софистической тантристской концепции. Когда нарушается равновесие жидкостей в организме человека, возникает болезнь.
В тибетской медицине отражена концепция, которая изложенная в Аштанга Хридая самхите Вабхаты. Она сообщает, что существует три типа болезней. Болезни, которые возникли вследствие «патогенных факторов современной жизни», вылечиваются лекарственными средствами или обрядами экзорцизма. Есть такие, которые являются последствием неправильной жизни в прошлом (могут быть вылечены духовной практикой); и те, причины которых сочетают в себе и то и другое. Исследование тибетского врача начинается с прощупывания пульса, с вопросов к больному, с внешнего обследования и реже с анализа мочи. В числе терапевтических методов, есть рекомендации по питананию и образу жизни, лечению отварами трав, порошками и пилюлями натурального происхождения.
Тибетская медицина неразрывно связанна с религией, и не может быть отделена от религиозных практик и ритуалов. Четыре Тантры рационально объединили в себе биологические изыскания, теорию Аюрведы и буддийскую философию. Как написано в «Четырех тантрах», «страдание всегда с человеком, даже если он чувствует себя хорошо; оно – как тень под птицей, которая летит в небе». Согласно тибетской медицине, биологическое существование человека обусловлено ментальными процессами, и цепь воплощений может быть разорвана только с помощью прорыва сознания – путем познания истины.