За основу мотоцикла был взят тот же 1-цилиндровый двигатель Minarelli, объемом 659 куб. см., выдающий 48 л.с. мощности и почти 60 Нм крутящего момента. Данный мотор ставится также на модель MT-03. В отличие от эндуро, модель Yamaha XT660X имеет ряд существенных изменений: Уменьшен вылет вилки на 1,25 градусов. Ход передней подвески уменьшен до 200 мм (с 2007 г. - 191 мм), элементы подвесок более жесткие. Спицованные колеса Excel на 17 дюймов. Более мощный передний тормоз - диск 320 мм, 4-поршневой суппорт Brembo. Увеличенная снаряженная масса - 186 кг против 181 кг у XT660R. Из характерных особенностей Yamaha XT660X следует выделить стальную раму, простые подвески в виде обычной телескопической вилки и моноамортизатора, инжекторную систему питания двигателя, 5-ступенчатую КПП, топливный бак на 15 л и 186 кг снаряженной массы. 2014 год стал последним годом производства Yamaha XT660X, после чего она покинула рынок и дальнейшего развития не получила. Модель .........Yamaha XT660X