Российские ученые из Санкт-Петербургского государственного университета путем геномного исследования доказали, что у населения Пскова, Новгорода и Якутии есть общий предок. Сравнительный анализ, опубликованный в научном журнале Genomics, прослеживает генетическую историю выборочных групп.
Подобные генетические исследования могут оказаться весьма полезными при выявлении генетически заложенных факторов риска в различных популяциях россиян, отмечает статья "Анализ геномной последовательности этнических популяций по всей России".
Многонациональная Российская Федерация дает генетикам огромное поле для деятельности, но пока что генетическое разнообразие народов изучено недостаточно. Научные исследования рассматривали либо конкретную популяцию, либо часть генома, а ведь сравнительный анализ данных всего генома из разных популяций может выявить данные о распространении заболеваний и резистентности к ним.
Для восполнения пробелов в геномных данных российских народностей Санкт-Петербургский государственный университет запустил проект «Российские геномы», в рамках которого ученые из различных организаций создали базу данных о генетических данных населения России.
Геномный анализ трех российских популяций
Генетики из СПГУ проанализировали 204 набора данных генома различных популяций из других работ и добавили 60 новых геномов из Пскова, Новгорода и Якутии. Всего в ходе исследования было опрошено 264 представителя 55 этнических групп.
Петербургские генетики использовали специальную программу, написанную в Университете ИТМО, чтобы предсказать демографическую историю для трех из этих групп населения. Эта демографическая история описывает развитие населения: как и когда они были одним наследственным населением, как изменился размер населения и каков был темп их миграции.
«Мы разработали программу для поиска оптимальной демографической истории в соответствии с геномами выборок популяций. Для этого потребовался расчет и анализ частоты встречаемости различных аллелей. Затем программа построила множество демографических историй, чтобы выяснить, какая из них наиболее подходящая для этих данных », - поясняет Екатерина Носкова, с.н.с. Лаборатории компьютерных технологий Университета ИТМО.
Выяснилось, что предки нынешних псковитян, новгородцев и якутов были одним населением около 2000 человек. Но 7000 лет назад якуты отделились от него, а около 1200 лет назад представители Пскова и Новгорода разделились. С тех пор все три популяции стали резко увеличиваться.
По мнению ученых, сравнение геномов разных популяций и история их развития помогает понять, какие варианты генов вызывают заболевания, а какие защищают от них. Поэтому следующим этапом исследования будет тщательный анализ данных и поиск корреляции с заболеваниями.