Если обособленное подразделение до снятия с учета не успело отчитаться по 2-НДФЛ, то справки нужно сдать по месту учета головной организации. Указать в них ее КПП. А код ОКТМО указать тот, который был у закрытой "обособки".
Документы: Письмо ФНС России от 01.04.2019 N БС-4-11/5938@