Главной прокуратурой в Российской Федерации является Генеральная прокуратура во главе с генеральным прокурором. Генеральной прокуратуре подчиняется военная прокуратура, которая имеет свою собственную структуру, отличную от структуры иных прокуратур, а сотрудники данной прокуратуры обладают статусом военнослужащих и имеют воинские звания. Также генеральной прокуратуре подчиняются территориальные прокуратуры субъектов (краевые, областные, республиканские, городов федерального значения и т.д.) и приравненные к ним транспортные. При этом транспортные прокуратуры имеют структуру, территориально не совпадающую со структурой субъектовых. К примеру Тюменская транспортная прокуратура подчиняется Уральской транспортной прокуратуре, а не прокуратуре Тюменской области. Транспортные прокуратуры занимаются надзором за соблюдением законодательства на (внезапно) всех видах транспорта, кроме автомобильного и за линейными отделами полиции. Субъектовым территориальным прокуратурам подчинены прокуратуры