Весь заработок фермера из Танзании - маниок (растение на картинке). Но его губят различные вирусы, дико быстро мутирующие и встраивающиеся в ДНК заражённых растений. Если с ними не бороться, придётся мириться с потерей всего урожая клубней.
Никакие химикаты здесь не помогут. Нужно определять заражённые растения ещё до проявления симптомов и отделять здоровые. Но делать это, имея на руках, например, антитела к типичным маркерам не выйдет, ведь вирус мутирует очень быстро. С распознанием по коротким характерным особенностям ДНК то же самое.
И вот здесь наши герои, учёные из Австралии, прибывает в Африку с карманным секвенатором MinION, разработанным Oxford Nanopore Technologies в 2016 году для борьбы с эболой. В течение двух суток их приборчик проводит секвенирование, выдавая нужный результат, для анализа которого на ноуте, взятом с собой, даже интернет не нужен.
Результат - спустя год семья из полуголодного существования перешла к отстройке своего дома на избыток от продажи урожая маниока.
А в этом августе наши учёные вернулись ещё и с новой системой извлечения ДНК. Все их модификации позволили к концу поездки (в Кении) достигнуть скорости секвенирования в 2-3 часа с ошибкой 3%. Просто подумайте: пара часов вместе полугода!
Такие истории вдохновляют, вот оно: учёный поехал в Африку помогать людям - что может быть замечательнее. Ну, ровно до того момента, когда оказывается, что выделять денежки на финансирование такого не очень торопятся.
Если вы неравнодушны к самым интересным новостям биологии, обязательно подписывайтесь на О живом.
Источник www.pnas.org/content/116/9/3351