Минфин дал положительный ответ на этот вопрос в письме от 21.02.2019 № 03-07-11/11286.
Ссылаясь на пункт 7 статьи 171 НК РФ с учетом п. 18 Правил ведения книги покупок (утв. пост. Правительства от 26.12.2011 № 1137), ведомство отмечает, что вычеты НДС по услугам по проезду к месту служебной командировки и обратно, в том числе затраты на пользование в поездах постельными принадлежностями, затраты на наем жилых помещений производятся на основании БСО, оформленных на командированного. Но сумма налога должна быть выделена отдельной строкой и включена им в отчет о командировке.
При том Трудовой кодекс предусматривает оплату работникам, которых фирма направляет на профобучение или дополнительное профобразование, на прохождение независимой оценки квалификации с отрывом от работы в другую местность, командировочных расходов в порядке и размерах аналогичным служебным командировкам (ст. 187 ТК РФ).
Таким образом, можно принять к вычету и НДС по затратам на проезд и проживание при обучении с отрывом от производства.