«Миссия Невыполнима: Протокол: Фантом» считается фильмом, который, если не вернул Тома Круза в большой Голливуд, то уж точно возродил интерес к серии про Итана Ханта. Однако, как выяснилось благодаря болтливому оператору фильма — Круз согласился сниматься, зная, что это будет его последний в фильм в качестве вечно бегающего агента. Роберт Элсвит, оператор «Протокола Фантом» рассказал, что съемки фильма шли полным ходом, когда Круз и студия решили исправить сценарий, т.к. он был «неубедительным». Никому [в Голливуде] нет дела до того, что я говорю, поэтому я просто скажу: в оригинальной версии Том Круз переставал быть Итаном Хантом агентом и переходил на роль руководителя организации. Весь фильм шел к тому, что в конце франшизу передадут другому актеру: Джереми Реннеру или там, не знаю кому. Элсвит рассказал, что съемки начались, но сценарий был настолько «так себе», что его захотели хоть немного улучшить, а поэтому пригласили Кристофера МакКуорри, который, кстати, в титрах не указа