Уникальность раковых клеток может помочь врачам применять более действенное лечение. Благодаря тому, что не все раковые клетки одинаковы, терапия имеет все шансы на то, чтобы стать персонализированной, отмечает публикация в научном журнале PNAS.
Знание генетических вариаций раковых клеток может помочь нам разработать целевые методы лечения, уверяет генетик Родольфа Мари из Дании. По ее словам, если сравнить геномы двух раковых клеток, они окажутся совершенно разными. Эта генетическая изменчивость - одна из отличительных черт рака, она же является и ответом на вопрос, отчего так сложно лечить рак.
Если опухоль состоит из клеток с множеством разных геномов, одно лекарство не одолеет все пораженные раком клетки. Но знание генетических вариаций может помочь в разработке целевых методов терапии.
В доказательство этих слов ученые из Дании провели целое исследование: они взяли одну раковую клетку, извлекли ее ДНК и получили грубую картину последовательности этой ДНК.
Оптическое картирование ДНК из одной клетки
В своем исследовании датские генетики использовали технику, называемую оптическое картирование, которая предоставляет крупномасштабную информацию о геноме.
Картирование - это своего рода карта мира с лесами, озерами и горами, но без подробностей вроде сел, домов, дорог. Карта ДНК раковой клетки и эталонная клетка сильно отличаются, вот тут ученые могут обнаружить геномную гетерогенность в опухоли и даже указать, как клетки поражались раком и превращались в злокачественную опухоль.
Что лучше: секвенирование или оптическое картирование?
Возникает вопрос: зачем нужно применять картирование, если есть методы куда продвинутее, например, секвенирование ДНК?
Обычные методы секвенирования ДНК имеют преимущество в том, что они имеют разрешение одной пары оснований, а это означает, что каждая пара оснований в молекуле ДНК может быть опознана. При наличии большого объема материала за пару дней можно выделить весь геном из человеческой клетки (шесть миллиардов оснований, в среднем).
Однако в этом случае сложно упорядочить единственную копию человеческого генома. Генетики отмечают, что и это не самое страшное, ведь теоретически есть более очевидный и эффективный способ считывания последовательности ДНК. Геном кодируется на 48 молекулах ДНК, в волокнах толщиной два нанометра, длиной до восьми сантиметров.
Далее методы комбинируются: оптическое картирование и секвенирование дополняют друг друга. Их данные восполняют пробелы и дают максимально полную картину, которая может помочь в выборе терапии рака.