Товары из Азии свозились в город многочисленными морскими караванами, где они обменивались на товары из Испании, Мексики и Перу. Огромное количество торговых судов привлекло в эти края пиратов всех мастей. Пиратские рейды были достаточно частым явлением в здешних водах. Несмотря на свою коммерческую важность, город был достаточно бедным. В городе имелось всего три здания достойных упоминания: форт, госпиталь и капелла Святого Иосифа.
В 1592 году была построена отличная дорога из Акапулько в Мехико.
В 1599 году Акапулько получил статус города. В 1776 году для защиты города от пиратов был построен знаменитый форт Сан Диего. В 1811 году во время войны за Независимость, Хосе Мария Морелос предпринял попытку захватить форт Сан-Диего, которая закончилась неудачей. Двумя годами спустя он был более удачлив и захватил форт, однако вскоре был изгнан испанскими войсками.
Форт оставался последним оплотом испанского вице-короля на тихоокеанском побережье Мексики до 15 октября 1821 года, когда его защитники были вынуждены сдаться.
Во времена французской интервенции Акапулько превратился в серьезный стратегический пункт. Войска захватчиков атаковали порт с моря в январе 1863 года. Французские корабли простояли тут всего три дня. Однако в июне город был снова захвачен и удерживался французами вплоть до конца 1864 года, когда Висенте Хименес и Диего Альварес разгромили империалистов при Эль Сапотале. В 1865 году город снова подвергся нападению французов, но республиканцы выстояли и изгнали интервентов.
В 1927 году было открыто железнодорожное сообщение между Акапулько и Мехико. Поездка на поезде занимала более недели, однако нашлось немало путешественников, осмелившихся на такой переезд, что вскоре подтолкнуло власти города к строительству первого отеля в 1934 году. С данного момента популярность Акапулько начала расти. Строительство аэропорта обеспечило приток иностранных туристов (в основном из США), которые по достоинству оценили красоту здешних мест и Акапулько приобрел всемирную славу респектабельного курорта.