Первая фахверковая церковь в Даркемене была построена в 1615 году. В 1752 году здание было снесено из-за ветхости, а на его месте было построена новая кирха, освященная 15 сентября 1754 года. Эта кирха была снесена в 1836 году, после чего началось строительство новой.
Новое кирпичное здание кирхи в Даркемене с невысокой башней и небольшой алтарной нишей было освящено 9 сентября 1842 года. В кирхе был установлен орган, привезенный из Тракхаймской кирхи Кёнигсберга. В 1892 году была произведена реконструкция кирхи, с западной стороны надстроена высокая башня, на которой были установлены трехцеферблатные часы работы мастера Л. Розе. Там же в конце XIX — начале XX века служил самый известный проповедник Европы — пастор Рогге.
Кирха не пострадала ни в Первую мировую войну, ни во Вторую. Но после войны ее передали техникуму: в здании стояли сельхозмашины и проводились практические занятия. Потом кирху у техникума отобрали. С тех пор здание не имеет хозяина и постепенно разваливается. Позже было обнесено забором. Из-за отсутствия ухода и ремонтов в 1994 году обрушилась крыша.
Напротив кирхи находится братская могила умерших от ран немецких и русских офицеров Первой мировой войны.
Постановлением Правительства Калининградской области в 2007 году кирха получила статус объекта культурного наследия регионального значения. В 2010 году кирха передана РПЦ. которой до этого не принадлежала.
На октябрь 2020 года сохранились стены кирхи шпиль с башни рухнул, окна частично заколочены досками, частично — заложены кирпичом, внутреннее пространство кирхи заросло травой и кустарником. Собственник никаких реставрационно-восстановительных работ не производит.
