Такая ошибка возникает в панели управления Рутокен при попытке назначить сертификат ключевой паре.
Ошибка из-за кодировки сертификата.
Исправляется просто:
1. Двойным кликом открываем сертификат
2. Вкладка "Состав"
3. Кнопка "Копировать в файл", откроется матер экспорта
4. Далее -> Кодировка DER -> Имя файла любое (можно выбрать его же, т.е. заменить) -> Далее -> Готово
Теперь можно подгружать сертификат
Всё:)