Несмотря на то что большинством специалистов ведущая роль в ольмекском пантеоне и изобразительном искусстве отводится ягуару, совершенно очевидно и наличие других, не менее ярких образов. В первую очередь, это представители водной стихии, грозные хозяева рек, проток и лагун - крокодилы и кайманы.
Исторически на территории Мезоамерики обитали три вида этих животных - Crocodylus moreletii, Crocodylus acutus и Caiman crocodylus fuscus.
C. moreletii, несмотря на небольшие размеры (1-1,5 м), исключительно агрессивен по отношению к человеку, С. acutus значительно крупнее (в среднем по 3-4 м, а отдельные экземпляры достигают 7 м) и мощнее. Он способен заплывать в океан на расстояние до полукилометра от берега. Перед нападением на животных или человека делает глубокий нырок. Неприятно и громко «рычит» во время спаривания. Исключительно опасен в состоянии голода, при защите своей территории или потомства. С. с. fuscus не превышает 1,2-1,75 м в длину и менее агрессивен. Естественно, что ареалы их обитания сильно сократились со времени формативного периода. С. moreletii сегодня близок к исчезновению, нет также недавних свидетельств присутствия С. acutus и С. с. fuscus на атлантическом побережье Мексики.
В скульптуре, пластике и орнаментике ольмеков много элементов, указывающих на крокодила, - скрещенные зубы, вывернутые губы, пальцевидные конечности и др. Некоторые усматривают аналогии крокодильего панциря или чешуи змеи в многослойных выкладках из плиток серпентина в Ла-Венте.
Одна из смелых гипотез - гипотеза о том, что остатки набольших искусственных водоемов (прудов) и системы отвода воды в Сан-Лоренсо свидетельствуют о разведении в этом центре крокодилов для употребления в пищу и для торговли. Части их тел и скелета служили важными предметами торговли, а также играли роль статусных и ритуальных символов.
Яркие образцы искусства с изображением крокодила в рамках формативного периода известны по всей Мезоамерике. Наиболее эффектные - фигура сидящего человека с наброшенной на плечи шкурой крокодила из Атлиуауана (штат Морелос) и изображение крокодила на стеле 25 в Ицапе (штат Чиапас). В мезоамериканской мифологии (в частности, у майя) в качестве животных, поддерживающих наш мир выступали именно крокодилы.