Родился Фредди в одном из старейших районов Занзибара – Каменном городе. Родители дали ему имя Фаррух при рождении. В 1952 у него появилась сестра, которую назвали Кашмира.
Когда ему исполнилось 8 лет, родители отправили ребенка в школу Святого Петра в Индии. Попав в город Пангачи, мальчик начал проживать с тетей и своим дедом. Уже учась в школе, он начал называть себя Фредди и увлекся рок-н-роллом. Проходя обучение в школе Фредди начал преуспевать в школьной программе, а также активно участвовать в спортивной жизни.
Так в десятилетнем возрасте, он стал чемпионом школы по настольному теннису, а уже в двенадцать лет за победу в юношеском многоборье получил кубок. Он также активно увлекался рисованием и пением, учувствовал в школьном хоре.
Начиная с 1958 года, Фредди и еще 4 друзей из школы, создали свою первую рок-группу и начали выступать, в основном, на танцах, школьных вечерах и юбилеях. Дела изменились в 1962 году, когда провалив выпускной экзамен, Фредди бросил обучение и вернулся в Занзибар. Но уже в 62, все семейство Меркьюри, захватив с собой всего пару чемоданов, отправились в Великобританию. Этому поспособствовали массовые политические беспорядки, начавшиеся в стране.
Оказавшись в Великобритании, семейство поначалу остановилось у родственников, а затем приобрели собственный дом. Поскольку денег семье катастрофически не хватало, Фредди во время каникул подрабатывал: вначале в отделе снабжения аэропорта Хитроу, а затем грузчиком на торговом складе.
В мае 66, Фредди поступил в художественный колледж в Лондоне, где проходил обучение на кафедре графического иллюстрирования. Позже, вместе со своим другом Крисом Смитом, он поселился в съемной квартире в Кенсингтоне, который в те годы был сердцем лондонской богемы и искусства.
История Фредди и группы Queen начинается в апреле 1970 года, когда вокалист Тим Стаффел решил покинуть тогда еще малоизвестную группу Smile и его место занял Меркьюри. Позже, по инициативе Фредди, название группы сменилось на Queen. До февраля 71 года сменилось 3 участников группы и, следовательно, отсутствовал постоянный басист. Но ситуации изменилась случайным образом, когда на одной из вечеринок они не встретили Джона Дикона. После этого состав группы сформировался окончательно.
Смена фамилии с Булсара на Меркьюри произошла в 1972 году, во время записи дебютного альбома Queen. Он решил использовать свой творческий псевдоним. Это имя он использовал в песне «My Fairy King», где звучат строки «Mother Mercury, look what they’ve done to me, I cannot run I cannot hide».
Авторство первой песни группы «Seven Seas of Rhye», которая попала в британские чарты принадлежало Фредди. Он также стал автором таких хитов как «Killer Queen», а также «Bohemian Rhapsody». Песне предрекали полный провал, поскольку для того времени, продолжительность сингла была долгой (5:55). Но Queen выпустили песню в качестве сингла и сняли к ней видеоклип. Можно однозначно сказать, что это помогло. Это был грандиозный успех группы. Песня продержалась на вершине британского хит-парада девять недель.
В 1975 году Queen гастролировала в Японии. Музыканты были крайне удивлены горячим приёмом японских поклонников группы. Фредди влюбился в Японию и стал фанатичным коллекционером японского искусства.
В 1980 году произошла смена образа Фредди, он отрастил усы и коротко постригся и отрастил усы. После того как, в конце 82 года группа заявила что весь следующий год гастролей не ожидается и уходит в отпуск, Фредди решил осуществить свои замыслы и начинает записи сольных проектов. В тоже время происходит знакомство с композитором Джорджо Мородером, который в то время был привлечен в качестве композитора для создания музыкальной части для готовящегося фильма. Он предложил Меркьюри принять участие в этом проекте. Итогом совместной работы Меркьюри и Мородера стала песня "Love Kills", которая увидела свет 10 сентября 1984 года.
Первым синглом Меркьюри стала песня «I Was Born to Love You», которая была выпущена 9 апреля 85 года. Сам альбом вышел через три недели. Позже, две композиции из данного альбома — «Made in Heaven» и «I Was Born to Love You», — были перезаписаны участниками Queen для альбома Made in Heaven.
Самым особенным днем для группы Queen,и Фредди в частности, стало 13 июля 85 года. Тогда состоялся концерт Live Aid, шоу, проходившее на стадионе «Уэмбли», где присутствовало порядка 75 тысяч зрителей. Трансляции этого концерта транслировались по всему миру.
Через год, 12 июля 86, группа снова выступила на этом стадионе. На этот концерт пришло более 120 тысяч человек. Завершающее шоу этого тура прошло 9 августа, оно стало последним выступлением группы Queen с Фредди.
В марте 1987 года состоялась встреча Фредди с Монтсеррат Кабалье в Барселоне в отле Ritz. В качестве подарка Меркьюри подготовил кассету с парой своих новых песен, которые произвели сильное впечатление на Кабалье, и она даже исполнила одну из них на концерте в Лондоне в Ковент-Гарден.
В начале апреля 1987 года Меркьюри и Кабалье начали работу над совместным альбомом. В конце мая в знаменитом «Ку-Клаб» на острове Ивиса состоялся музыкальный фестиваль, где Меркьюри и Кабалье были почётными гостями. Они исполнили на фестивале песню «Barcelona», которую Меркьюри посвятил родному городу Кабалье.
Альбом Barcelona вышел 10 октября 1988 года. Заглавная песня альбома, «Barcelona» стала одним из двух гимнов Летних Олимпийских игр в Барселоне 1992 г.
В 1986 году начали появляться слухи о том, что Фредди Меркьюри болен СПИДом. Изначально в прессу попала информация о том, что он сдавал тест на ВИЧ. С 1989 года стали проявляться серьёзные изменения во внешности Меркьюри — он сильно похудел. Однако вплоть до последних дней жизни музыкант отрицал все слухи относительно своего здоровья. О его диагнозе знали только близкие люди. Истинная причина возникновения заболевания у Меркьюри до сих пор остаётся неизвестной.
В 1989 году группа Queen дала первое за несколько лет совместное интервью на радио, где сообщила о том, что хочет отступить от привычной схемы «альбом-тур», в связи с чем в тур на этот раз не поедет. Настоящая причина была в том, что физическое состояние вокалиста группы не позволяло проводить концерты.
Меркьюри, зная, что времени осталось мало, старался записать как можно больше песен. За последние годы жизни кроме своего сольного альбома Barcelona музыканту удалось записать песни к ещё трём альбомам группы. При его жизни было выпущено два альбома — The Miracle, который вышел в 1989 году и Innuendo , вышедший в 1991 году. Также к песням этих альбомов было снято несколько видеоклипов. К альбому Innuendo некоторые клипы снимались в чёрно-белом варианте, чтобы завуалировать физическое состояние вокалиста.
Он также распорядился передать все права на песню «Bohemian Rhapsody» фонду Теренса Хиггинса, созданному для противостояния ВИЧ и СПИД. На следующий день, 24 ноября, около семи часов вечера Фредди Меркьюри скончался в возрасте 45 лет в своём доме в Лондоне от бронхопневмонии, развившейся на фоне ВИЧ-инфекции и СПИД.
Похороны Фредди Меркьюри проводились закрыто — присутствовали только родные и близкие. Личный помощник Фредди Меркьюри, так описывал церемонию:
Гроб с телом Фредди перенесли в часовню под звуки песни Ареты Франклин «You’ve Got a Friend». Последовавший затем зороастрийский обряд был продолжением церемонии, начавшейся в полдевятого утра. Два священника-парса, облачённых в белые одежды, проводили её в поминальной часовне похоронного бюро «Джон Нодс и сыновья» в Лэдбоук-Гроув. В конце службы тело Фредди покинуло мир в сопровождении голоса Монсеррат Кабалье, исполнявшей арию «D’Amor Sull’ Ali Rosee».
Тело Фредди Меркьюри было кремировано. Только его семья и Мэри Остин знали, где покоится прах музыканта — таким было его желание.
В завещании Фредди Меркьюри оставил большую часть своего состояния, в том числе особняк и доход от продаж его пластинок, Мэри Остин, а также своим родителям и сестре. Кроме того, по 500 тысяч фунтов было завещано его шеф-повару Джо Фанелли, личному помощнику Джиму Хаттону, а его личному шофёру Терри Гиддингсу — 100 тысяч.
Официальное заявление Фредди Меркьюри:
«Учитывая слухи, ходившие в прессе последние две недели, я хочу подтвердить: анализ моей крови показал присутствие ВИЧ. У меня СПИД. Я считал нужным держать эту информацию в секрете, чтобы сохранить спокойствие родных и близких. Однако пришло время сообщить правду моим друзьям и поклонникам во всём мире. Я надеюсь, что каждый присоединится к борьбе с этой ужасной болезнью»