В Агдаме есть собственный профессиональный футбольный клуб — «Карабах», восьмикратный чемпион Азербайджана и шестикратный обладатель Кубка Азербайджана. Это первая футбольная команда в истории Азербайджана, которой удалось пройти в групповой этап Лиги Чемпионов.
Собственно, окончательное название, «Карабах», футбольный клуб получил в 2004 году, а до этого носил название «Мехсул», «Шафаг», «Кооператор», «Карабах», «Карабах-Азерсун».
Футбольный клуб официально представляет город Агдам. До начала Карабахской войны футбольная команда участвовала в домашних матчах в Агдаме, а с середины 1990-х до середины 2009 года — в Баку. Позже, в апреле 2009 года, футбольный клуб передислоцировался в поселок Гузанлы Агдамского района, принимал гостей на стадионе Олимпийского комплекса. С сентября 2015 года домашние матчи «Карабах» проводит в Сураханском районе Баку, на новом стадионе «Азерсун Арена», рассчитанном на 5 800 зрителей.
Еврокубковые матчи футбольный клуб принимает на республиканском стадионе им. Т. Бахрамова и Олимпийском стадионе Баку, вместимостью 31 200 и 69 870 человек, соответственно.
Историческая справка. История футбольного клуба начинается в 1950-х годах — «Мехсул» появился после завершения строительства городского стадиона. В 1966 году команда впервые играла в чемпионате Азербайджанской ССР, показав неплохие результаты — клубу удалось занять четвертое место. Через два года «Мехсул» занял уже второе место, но после этой победы в команде начинается разлад и футбольный клуб разваливается, оставаясь за бортом чемпионатов до 1977 года.
1977 год стал для команды вторым рождением. Меняется название клуба на «Шафаг» и сразу клуб начинает играть во второй лиге чемпионата Азербайджанской ССР. Пять лет команда единственная представляет Агдам в чемпионате. С 1982 по 1987 год футбольный клуб выступает под новым именем — «Кооператор».
Впервые чемпионом Азербайджанской ССР «Карабах» становится в 1988 году, получая право участвовать во второй лиге чемпионата ССР. Год спустя команда играла в девятой зоне чемпионата СССР, заняв там 11 место.
После распада СССР, в 1992 году, в независимом Азербайджане был проведен первый чемпионат. В 1993 году для агдамцев наступили тяжелые времена — Агдам был оккупирован вооруженными силами Армении. Аллахверди Багиров, некогда тренировавший игроков, погиб в автомобиле, подорвавшись на мине.
Клуб стал проводить домашние игры в Баку. С 1998 года по 2001 год клуб показывал самый слабый результат среди сильных команд, а из-за плохого финансирования команду стали покидать ведущие игроки. На помощь пришли меценаты: в 2001 году крупный холдинг Азербайджана «Азерсун» взял над клубом шефство — в этот период удалось вернуть почти всех футболистов, покинувших команду ранее. С этого времени команда стала называться «Карабах-Азерсун», и в 2003/04 годах ей удалось завоевать третье место чемпионата.
Следующий сезон команду тренировал Игорь Пономарев, бывший форвард «Нефтчи». В клуб были приглашены лучшие азербайджанские футболисты, и в 2004 году команда вернула свое название «Карабах». Также был разработан логотип футбольного клуба — карабахские скакуны.
Сезон 2005/06 начался под предводительством молодого тренера Эльхана Абдуллаева, но в зимний перерыв его заменили на более опытного Беюкагу Агаева — именно при Агаеве команде удалось забрать Кубок Азербайджана, получив путевку в Кубок УЕФА.
Следующий сезон был несколько неудачным для команды, в результате чего опять произошла замена главного тренера — на этот пост заступил турецкий специалист Расим Кара. С 2009 клуб регулярно выступает в Лиге Европы УЕФА, при этом три раза команда выходила в раунд плей-офф.
Сезон 2014/15 стал также удачным для «Карабаха», команда второй раз стала чемпионом страны, получив право играть в Лиге Чемпионов. В результате матчей «Карабах» получил право сыграть в групповой стадии европейского турнира. В следующих двух сезонах клуб также добирался до групповой стадии Лиги Европы УЕФА.
В 2017 году «Карабах» вышел в групповой этап Лиги Чемпионов. В результате «Карабах» сыграл вничью с «Атлетико Мадрид», с «Атлетико», проиграл «Челси» и итальянской «Роме», в итоге заняв последнее место в своей группе С.
