Отправляясь в 1219 году на войну с Хорезмом, Чингисхан разделил свою империю на несколько уделов, которые раздал своим сыновьям для большей прочности созданного им государства. Свой улус (причем самый богатый) получил и третий сын Угэдэй, волей случая ставший в том же году наследником ханского престола, но о даре отца он никогда не забывал и именно улус Угэдэя стал центром Монгольской империи, а затем - самым прочным из монгольских государств.
Своему третьему сыну, пусть и не очень любимому из-за проблем со спиртным, Чингисхан приготовил в дар лучший удел, включавший в себя Западную Монголию, Синьцзян, восточный Казахстан и Алтай и имевший все, что только душа пожелает: плодородные почвы, обилие воды, месторождения полезных ископаемых, но по воле судьбы Угэдэй, сумевший разнять драку братьев перед лицом отца, стал ханом всех монгол и в своем улусе бывал только наездами, но о нем никогда не забывал, справедливо считая именно его основой своей силы.
После смерти третьего хана всех монгол Гуюка в 1248 году Улус Угэдэя стал главным очагом сопротивления центральной власти, ведь правившие там Угэдеиды считали себя, а не Толуидов (потомков четвертого сына Чингисхана Толуя) достойными ханского престола в Каракоруме. Новый хан всех монгол Мунке решил перестраховаться и при вступлении на престол в 1251 году попросту вырезал всех Угэдэидов, а территорию их владений присоединил к своему родовому улусу. Из всех Угэдэидов уцелел лишь 15-летний внук Угэдэя Хайду, сумевший бежать к родственникам по материнской линии в Тарбагатайские горы (Бурятия, Россия). После смерти Мунке Хайду поднял восстание против его братьев Хулагу и Хубилая. Заручившись поддержкой Джучидов, к тому времени окончательно перелаявшихся с центральной властью, Хайду восстановил независимость своего улуса, а в 1269 году созвал курултай в Таласе, на котором был закреплён распад Монгольской империи.
Юридически закрепив независимость своего улуса, Хайду и его преемники принялись за решение его внутренних проблем, в частности, подавление сопротивления со стороны енисейских кыргызов. Монголо-кыргызские войны завершились только в 1272 года почти полным истреблением последних, за исключением тех немногих, кто согласился жить в монгольском рабстве и тех, кто сумел уйти на Тянь-Шань и Памиро-Алай, где и возродилось Кыргызское государство.
Добившись этнической однородности населения своего улуса (остатки местных тюрок, к тому же порядком ассимилированные, не в счёт), Угэдэиды могли спокойно править в своём улусе, принципиально не обращая внимания на те потрясения, которые обрушились на монгольские земли в XIV веке. В 1399 году ойроты из Улуса Угэдэя, воспользовавшись гражданской войной в Монголии, захватили большую её часть и основали новое государство - Ойротское (с XVII века - Джунгарское) ханство. сыгравшее важную роль в истории Евразии.