Во время грозы 29 мая 1677 года Тобольск выгорел основательно. Молнии зажгли одновременно шатры церквей Знаменского со монастыря и Троицкую , Воскресенскую и Никольскую на горе. Монастырь сгорел весь. Из- за отсутствия воды башни и стены пытались залить квасом , из соседней квасной. Сгорела Софийская соборная церковь и постройки Софийского двора.
Целый год не велись работы по восстановлению