Крупномасштабное секвенирование геномов золотых рыбок и карпов открывает их происхождение

Фото рыбки утиное яйцо (слева) и рыбки вен (справа). Золотые рыбки вен имеют пышный хвост, совмещённый со спинным плавником, классические вариации включают веерохвоста и вуалехвоста («вен» — это также китайское название характерного нароста на голове у таких пород, как оранда и львиноголовка). Автор: Лиминг Ку

Большая команда исследователей из многих институтов в Китае секвенировала геномы большого числа золотых рыбок и карпов, раскрыв многое об их общем происхождении. Они опубликовали свои результаты в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.

Как отмечают исследователи, золотые рыбки содержатся человеком в неволе более 1000 лет, однако, в отличие от большинства одомашненных видов, они культивировались не для еды или компаньонства. Вместо этого они служат в основном для украшения. Вкусы людей сильно разнятся, так что и золотые рыбки выращивались для получения огромного числа отличительных черт, от различных окрасок до разных конфигураций плавников и хвоста. Такое сильно разнящееся выращивание привело ко многим изменениям в геноме золотых рыбок, но до настоящего момента эти изменения не были хорошо изучены.

Работа команды включала секвенирование геномов 185 типичных представителей пород золотой рыбки и 16 образцов дикого золотого карася. Предшествующее исследование показало, что золотые рыбки имеют 25 хромосом, но каждая отдельная рыбка имеет 100 — у них по два набора двух копий каждой. Также ранее было показано, что большая часть генетических вариаций, встречающихся в геноме золотой рыбки, достаточно недавние с точки зрения генетики — некоторые настолько недавние, что они представляют единственный вариант данной породы. Такие малые образцы известны как «выметания».

Работа учёных в этом новом исследовании включала изучение таких «выметаний». Проделав это, они обнаружили что даже верхний 1 процент всех «выметаний», которые они изучили, имел всего лишь чуть менее 1000 генов. Они заметили, что большинство обнаруженных различий были связаны с окраской и формой тела, однако также были и те, что связаны с поведением. Исследователи также секвенировали геномы нескольких яйцевидных золотых рыбок, породы без спинного плавника. Это позволило им определить около 400 генов. связанных со спинным плавником золотых рыбок.

Команда утверждает, что они собрали один из самых детализированных геномов золотой рыбки на данный момент и обнаружили генетическую архитектуру многих анатомически интересных особенностей популярной рыбки.

Источник.

Перевод Антон Меньшенин, редактор Елена Королёва.