В качестве отдельной породы эти кошки возникли около 150-200 лет назад в США, в штате Мэн. Название породы мейн-кун дословно так и переводится — Мэнский енот. Специально, путем скрещивая кошек разных пород, мейн-кунов никто не выводил. Они сформировались самостоятельно, под воздействием условий окружающей среды.
Своему формированию порода обязана естественному отбору. Предками этих кошек были питомцы первых американских переселенцев. Само собой, первые кошки, появившиеся на континенте, не отличались ничем от европейских, за исключением богатых длинношерстных пород. Скрещиваясь друг с другом, они оставляли самое разнообразное потомство. Но влияние суровых условий привело к тому, что выжить смогли только те кошки, которые одновременно были сильными и выносливыми, имели длинный и теплый мех, обладали мощными и широкими лапами, а также имели сообразительность выше среднего уровня.