Основная история Banana Fish состоит из шести частей, опубликованных в 19 томах: «Пролог» (том 1) «Тайна банановой рыбы» (тома 1–6) «Контратака Эша» (тома 7–11) «Возвращение Голзина» (тома 12–14) «Последняя битва» (тома 15–18) «Эпилог» (тома 18–19) Часть 1: Пролог Во время войны во Вьетнаме в 1973 году американский солдат Гриффин Калленриз в ошеломленном безумии стреляет по собственной эскадрилье. Он подчиняется, когда Макс Гленрид, друг и сослуживец, стреляет ему в ногу. Когда Гриффин падает в обморок, он произносит слова «банановая рыба». Часть 2: Тайна банановой рыбы Двенадцать лет спустя, Гриффин, теперь серьезно умственно отсталыми, ухаживает за его младшего брата Ash, лидер банды из беспризорников в Нью - Йорке . Однажды ночью Эш встречает смертельно раненого человека, который дает ему пузырек с неизвестным веществом и адрес в Калифорнии; мужчина произносит слова «банановая рыба» перед смертью. Ash начинает исследовать смысл «банановой рыбы», хотя он препятствует Дино Golzine, в корсиканского босса мафии , который ухоженной Ash как секс - рабыню во время своего детства и наследник его криминальной империи. В ходе своего расследования Эш собирает нескольких союзников: Шуничи Ибе, фотокорреспондента, и Эйдзи Окумура, его помощника, который приехал из Японии, чтобы сообщить об уличных бандах; Короче Вонг, лидер банды, контролирующий Чайнатаун; и Макс, с которым Эш встречает в тюрьме по ложному обвинению в убийстве. Когда Гриффин застрелен в драке с людьми Голзина, группа намеревается вместе разгадать тайну «банановой рыбы».
Эш и его союзники едут по указанному адресу в Калифорнии и находят особняк, занятый человеком, который, как выяснилось, был Ли Ют-Лунгом, младшим сыном крупнейшего преступного клана Китая. Позже они сталкиваются с истинным обитателем дома, доктором, который сообщает им, что банановая рыба - это не отслеживаемый наркотик, который «промывает мозги» своим потребителям. Гользин намеревается продать препарат правительству Соединенных Штатов, которое стремится использовать его для свержения коммунистических правительств в Южной Америке . Группа впоследствии захвачена людьми Голзина, которые вводят Шортеру банановую рыбу и приказывают ему убить Эйдзи. Когда Шортер умоляет Эша убить его в момент просветления, Эш смертельно стреляет в него. Часть 3: контратака Эша Группа, с помощью банд Эша и Шортера, покидает территорию Гользина. Эш использует манипуляции с акциями, чтобы подорвать стоимость законного бизнеса Гользина, и снимает с их счетов 50 миллионов долларов, создавая впечатление, что Гользин присвоил деньги. Гользин вынужден покинуть Соединенные Штаты, чтобы отвечать перед своим начальством во Франции.
В вакууме власти, созданном отсутствием Голзина, Эш получает обещания нейтралитета от Каина Блада, босса уличных банд Гарлема , и неохотного Синг Су-Линга, который захватил банду в Чайнатауне. Эш начинает методично уничтожать корсиканские уличные банды, выходя победителями, но тяжело раненными в финальном сражении. Он помещен в психиатрическое учреждение для лечения, которое, как выяснилось, финансируется Unione Corse , которые инсценировали смерть Эша, чтобы они могли использовать его в качестве испытуемого для наблюдения за воздействием банановой рыбы на живой мозг. Эш может сбежать с объекта, так же, как Гользин возвращается из Европы, чтобы восстановить контроль над корсиканской мафией. Часть 4: Возвращение Голзина Ют-Лунг, использовав банановую рыбу, чтобы перевести своего старшего брата в вегетативное состояние , заключает союз с Голзином. Ют-Лунг устраняет сообщников Гользина в проекте Banana Fish, в то время как Гользин устраняет других членов синдиката семьи Ли, делая этих двух мужчин фактическими лидерами корсиканской и китайской мафии в Нью-Йорке. Гользин и Ют-Лунг заключают контракт с Бланкой (бывшим наемным убийцей, обучавшим Эша) и угрожают убить Эйдзи, если Эш не вернется в Гользин и не завершит расследование Банановой Рыбы. Эш соглашается с их условиями, признавая, что он не может победить Бланку, и воссоединяется с Гользином в качестве своего советника и законно приемного сына. На вечеринке, устроенной Голзином, Эша спасает Эша при поддержке банд Синга, Каина и Эша.
Часть 5: Финальная битва Эш уходит в Американский музей естественной истории , хотя Эйдзи и несколько членов банды Эша попадают в плен в ходе последующей погони. Эш захватывает Ют-Лунга и освобождает его в обмен на свободу заложников. Позже Синг вызывает Эша на дуэль, чтобы уладить их недовольство. Эш и его союзники позже отражают нападение Эдуардо Фокса, наемника, нанятого Гользином, хотя несколько членов их банды попадают в плен. Группа отслеживает заключенных до психиатрической больницы, где ранее содержался Эш. В решающей битве Фокс и Голзин убиты, а все свидетельства проекта Banana Fish уничтожены. Часть 6: Эпилог Макс публикует расследование о детском секс-ринге Гользина в Newsweek , что спровоцировало скандал в Вашингтоне с участием нескольких политиков. Синг примиряется с Эшем и убеждает Ют-Лунга прекратить преследование Эйдзи и Эша. Ют-Лунг и Синг соглашаются работать вместе, чтобы восстановить контроль над Чайнатауном. Эш, осознавая опасность, которой подвергает Эйдзи, прекращает с ним контакт. Эйдзи и Ибе возвращаются в Японию, хотя незадолго до своего отъезда Эйдзи вручает Эшу письмо. В письме Эйдзи говорит, что, хотя он понимает, почему они больше не могут видеть друг друга, «моя душа всегда с тобой». Отвлеченный письмом, Эш получает удар ножом от лейтенанта и единокровного брата Синга, Лао Йен-Тай, который не знал, что Эш и Синг больше не собираются на дуэль. Эш стреляет в Лао, убивая его. Он идет в Нью-Йоркскую публичную библиотеку, где умирает, улыбаясь и сжимая в руке письмо Эдзи