На месте Покровского храма уже на рубеже XV—XVI веков стоял деревянный храм. Вероятно, он был сожжён во время нашествия крымского хана Девлет Гирея. Новый деревянный трёхшатровый храм построил боярин Никита Романов в конце 1610-х — начале 1620-х годов.Каменный Покровский храм возводился для царской усадьбы Измайлово при царях Алексее Михайловиче и Фёдоре Алексеевиче в 1671—1679 годах. Строили собор костромские мастера братья Медведевы, творившие под началом зодчего Ивана Кузнечика. Освящён в 1679 году патриархом Иоакимом в присутствии царя Фёдора.
Подрядная запись гласит: «Сделать в старом селе Измайлове церковь каменную против образца соборныя церкви, что в Александровской слободе, без подклетов длиною меж стен девять сажень, поперечнику тож, а вышина церкви и алтаря как понадобится, да кругом той церкви сделать три ступени как доведется, а делать нам то церковное каменное дело, как подмастерье укажет». Вот так, по-деловому кратко и точно. А между тем, собор этот был одним из гран
