Время постройки Ананури доподлинно неизвестно, первые письменные упоминания об этом комплексе относятся к 17 веку, однако согласно раскопкам, уже в 13-14 веках здесь было городище.
В прошлом крепость Ананури была гораздо больше по площади, с дополнительными охранными башнями и рядом стен. Дошедший же до наших дней верхний замок или цитадель, сохранил весь периметр оборонительных стен с