Потому что у гелия низкая плотность.
Голосовые связки упруго вибрируют в потоке воздуха. У гелия плотность в семь раз ниже, чем у воздуха, он меньше нагружает связки, и они колеблются с большей частотой, от чего голос становится писклявым.
А вот после вдыхания тяжелого газа фторида серы, который впятеро плотнее воздуха, даже женщины начинают говорить басом.