Яндекс.Дзен не платит за дочитывания. Если Вы вышли на монетизацию, то в публикуемых статьях на этой платформе размещаются рекламные блоки.
Схема примерно следующая:
Есть рекламодатель, который рекламирует свои товары / работы / услуги через Яндекс.Директ. Он платит за эту рекламу Яндексу.
Рекламные блоки Яндекс.Директа крутятся в том числе в статьях на Яндекс.Дзен.