За свою долгую жизнь святой Иоанн много плодотворно потрудился и написал множество различных сочинений в области научного богословия и песнетворчества. Эти сочинения дают ему почетное место в ряду великих Отцов Церкви. В них он проявил свою многостороннюю образованность и незаурядную талантливость в области веры и догматики. Тщательное изучение с ранних лет философии Аристотеля раскрыло в нем отчетливого мыслителя, невероятно точно формулировавшего богословские термины.
В своих трудах, святой Иоанн опирался на творения древних святых Отцов Церкви и фактически выступил собирателем святоотеческого предания. Видя в них общников Святого Духа, он считал их богодухновенными писателями и богоносными пастырями. При этом преподобный Иоанн различал частные мнения святых отцов и отеческое предание. «Единичное мнение не есть закон для Церкви», говорил он и повторял слова вслед за Григорием Богословом: одна ласточка не делает весны.
У святого Иоанна была способность выделять догматически важные вопросы богословия и большой дар систематизации и определений. Он тщательно и с любовью собирал и систематизировал все главное, что установили Соборы Церкви и чему учили величайшие богословы. В этом он проявил незаурядную начитанность святых Отцов. Преподобный Иоанн, дал полное и ясное изложение Православной веры, выдвигая твердое церковное основание во всех раскрываемых им вопросах.
В области церковной догматики святой Иоанн в 754 году написал труд — «Источник знания». Он подразделяется на три отдельные книги: на «Диалектик», содержащая изложение философии Аристотеля, на опровержение 103 ересей «О ста ересях вкратце» и на «Точное изложение Православной веры».
«Точное изложение православной веры» является главной книгой среди трех частей и является по своей сути первым опытом полной систематизации православного богословия. «Диалектика» представляет собой философское и методологическое введение к «Точному изложению», а книга о ересях – исторический обзор уклонений от православной веры, по своему характеру – каталог ересей.
В «Точном изложении православной веры» последовательно рассматриваются учение о Боге, Троице, о сотворении мира, ангелах и бесах, видимой природе и рае, о человеке, его свойствах и Божьем провидении, о свободе и воле человека, о Боговоплощении, Богочеловеке, о крещении, евхаристии, почитании святых, Святом Писании, о зле и конце мира. В этой книге святой Иоанн систематизирует в стройную систему все известное ему богословие и этот его труд до сих пор является непревзойденным для последующих поколений догматистов. Фактически это книга является прекрасным учебником классического богословия, как основа и норма догматических учебников поздних веков. В этой книге в стройной системе изложено то, чему учит Церковь, святоотеческие понятия и мысли, принадлежащие авторам начиная с первых веков христианства. В X веке она была переведена на славянский язык, в XII - на латынь.
Святым Иоанном были написаны христологические и полемические трактаты, которые можно рассматривать как дополнение к "Источнику знания", в которых святой Иоанн рассматривал взгляды противников православия и по этой причине более подробно осветил многие вопросы православной догматики, чем это было сделано в "Источнике знаний".
«Три слова против порицающих иконы» написаны в 730 году, в самом начале иконоборческого спора, немедленно после запрещения икон императором Львом III Исавром. Писания преподобного Иоанна имели такое значение, что иконоборческий собор 734 г. четырехкратно проклял «Мансура» (арабское имя святого Иоанна), как главного защитника иконопочитания. А в последствии, уже после смерти писания святого Иоанна были высоко оценены VII Вселенским Никейским Собором 787г. и использовались Собором как основа для вероучительных определений. В своих «Словах» в защиту икон Святой Иоанн Дамаскин исходил из понимания иконоборчества как христологической ереси. Иконоборцы основывали свое учение на ветхозаветном запрете кумиров, и игнорировали при этом Боговоплощение. В своей работе святой Иоанн раскрыл, что Иисус Христос есть действительный в Своем человечестве образ Бога Невидимого, «ибо в Нем обитает полнота Божества телесно» Кол.2.9. «В древности (то есть в Ветхом Завете) Бог, бестелесный и не имеющий вида, никогда не изображался. Теперь же, когда Бог явился во плоти и жил среди людей, мы изображаем видимого Бога»
Противостоя против обвинений в идолопоклонстве, святой Иоанн проводит различие между служением, подобающим лишь Богу, и поклонением, оказываемым тварным вещам, к чему относятся и иконы. Это терминологическое различие было утверждено Седьмым Вселенским Собором. «Слова» преподобного Иоанна против иконоборцев, таким образом, являются его самым значительным вкладом в православное вероучение.
Преподобный Иоанн также написал очень много своих гимнографических работ, ставших основой современного православного богослужения. Церковные песнопения преподобного Иоанна - исключительно ценная часть его духовного наследия. Ему приписывается авторство и введение в употребление канонов, совершенно изменивших строй богослужения. Именно преподобный Иоанн Дамаскин ввел каноны как форму песнопения в широкое употребление. В своих канонах Иоанн Дамаскин использовал уже существовавшие греческие поэтические формы. Предание приписывает преподобному Иоанну Дамаскину сочинение Октоиха, состоящего из цикла служб в течение восьми последовательных недель, поющихся в восьми различных «гласах» или мелодийных системах. Он также считается автором многих праздничных песнопений, в том числе пасхального канона, канонов на Рождество, Преображение, Успение, Вознесение и множества стихир, тропарей и кондаков, посвященных различным праздникам и святым.
Как систематизатор церковного вероучения преподобный Иоанн широко пользовался трудами святых отцов-предшественников, соединив их в единую систему.
Один из переводчиков «Точного изложения православной веры» Александр Бронзов в предисловии к своему переводу указывает, труды каких святых отцов использовал святой Иоанн в своих работах.
В изложении православного учения о Святой Троицы, преподобный Иоанн использовал труды святителя Григория Богослова в частности «50 слов» и «Пять слов о богословии» святителя Григория. Использовал также труды святителя Кирилла Александрийского «О Святой Троице». Использовал Корпус Ареопагитикум Дионисия Ареопагита, такие его части, как «Об именах Божиих», «О небесной иерархии», «О таинственном богословии». Широко пользовался книгами святителя Василия Великого «Книга против Евномия», «О Святом Духе».
В учении о Боговоплощении преподобный Иоанн пользовался трудами святителя Афанасия Александрийского «О воплощении Слова», «Слово против ариан», «Против язычников».
Чтобы раскрыть православное учение о Божьем творении, преподобный Иоанн использовал книги каппадокийцев, а также блаженного Феодорита Кирского, святителя Иоанна Златоуста, Дионисия Ареопагита, святителя Мефодия Патарского, святителя Афанасия Александрийского, святителя Севериана Гавальского.
В учении о природе человека использовал труды Максима Исповедника «послание к пресвитеру Марину», «О душе», «Диспут с Пирром». Книга «О природе человека» Немезия епископа Эмезы в Сирии сыграла значительную роль в описании природы человека, многие главы «Точного изложения православной веры» составлены исключительно по ней. Использовал книгу Григория Нисского «Об устроении человека».
Преподобный Иоанн использовал творения таких отцов, как святителя Льва, пары Римского, блаженного Леонтия Иерусалимского, святителя Анастасия Синаита, святителя Епифания Кипрского, святителя Кирилла Иерусалимского, святителя Иринея Лионского и многих других. И конечно же использовал постановления Вселенских Соборов.
Святого Иоанна уподобляют пчеле, заботливо и тщательно собирающей «приятнейший мед» с «цветов мыслей» многочисленных христианских писателей. Иоанн Дамаскин в своих творениях явился высоким образцом для догматистов последующего времени. Изучение и изложение сути каждого догмата, согласование с данными современной ему науки с целью приближения догматической истины к человеческому разуму, верность духу древней Вселенской Церкви до сих пор является примером для подражания в догматической науке.
После святого Иоанна долгое время не было подобных систематизаций вероучения. Греческие богословы занимались частными догматическими вопросами, касавшимися проблем текущего времени, пока наконец внешние обстоятельства Греции окончательно не ухудшились после ее оккупации турками. В таком виде богословская наука была воспринята на Руси. Среди русских богословов были предприняты попытки продолжить творения святого Иоанна. Наиболее выдающиеся работы были проделаны Петром Могилой в 17 веке «Православное исповедание кафолической и апостольской Церкви Восточной», в 19 веке труды архиепископа Филарета (Черниговского), митрополита Макария и епископа Сильвестра.