"Добро пожаловать в Убежище 13, новейшее детище фирмы Vault-Tec, лидера на рынке ядерных бомбоубежищ. Vault-Tec — последнее слово в американском домостроении."
В отличие от большей части убежищ во вселенной Fallout, жители данного бункера не подвергались никаким социальным экспериментам. Члены так называемой контрольной группы должны были выйти за пределы убежища через 200 лет после того, как двери закрылись. Однако все же одно условие существовало. Двери были закрыты ровно на 200 лет, то есть никто не мог выйти либо войти в данный бункер. Однако поломка водоочистной системы вынудила послать одного из жителей убежища за водяным чипом, без которого все резиденты были обречены. Поломка чипа не входила в планы "Волт-Тек". Из-за непредвиденной ошибки, все запасные чипы, которые предназначались для Убежища 13, были отправлены в Убежище под номером 8, где, по сути, лежали без дела.
Именно за выходца из Убежища 13 мы играем в первой классической части серии игр Fallout. И именно мы должны спасти всех жителей убежища, доставив тот самый заветный водяной чип. Думаю, почти всем вам известно то, что произошло в конечном итоге (если нет, то пропустите эту статью, здесь будут спойлеры). Так как жители убежища 13 должны были сохранять "чистоту" и не выходить на поверхность 200 лет, чтобы не подвергнуться действую радиации и болезней - Смотритель убежища изгнал нас после доставки чипа. Не всем жителям это пришлось по духу. Часть жителей последовала за Выходцем (то есть, за нами) на пустошь. Оставшиеся жители считали что за дверью бункера есть только смерть, и обвинила в этой самой смерти Смотрителя, приговорив его к смерти. Далее было решено не доверять более судьбы людей одному человеку. Для управления убежищем у Братства Стали был приобретён суперкомпьютер, который и исполнял все обязанности Смотрителя.
15 мая 2242 года в центральный компьютер Убежища 13 поступило сообщение от Анклава, что жителям убежища пора выбираться на поверхность. Чистые, нетронутые радиацией жители Убежища 13 нужны были Анклаву для экспериментов с Вирусом Рукотворной Эволюции (вирус, породивший Летунов, Кентавров и Супермутантов). На следующий день двери Убежища открылись, и всех жителей встретил отряд Анклава. Все, кто оказал сопротивление - был убит. Остальные же были доставлены на центральную базу Анклава. Чтобы скрыть свои преступления, в бункер были отправлены разумные Когти Смерти, которые были обработаны ВРЭ (Вирусом Рукотворной Эволюции). Те, в свою очередь, проявили милосердие к людям, и принимали всех обездоленных, предоставляя им кров и защиту.
После того, как Избранный из Fallout 2 уничтожил Анклав, беженцы из его родной деревни Арройо и оставшиеся в живых жители Убежища 13 построили новое поселение. Технические знания жителей бункера и навыки выживания жителей Арройо поспособствовали росту и процветанию их общего поселения. Избранный стал Старейшиной поселения и руководил Нью-Арройо долгие годы.