Кандидат геолого-минералогических наук, до сих пор возглавлявший кафедру геологии и полезных ископаемых Башкирского государственного университета, получил назначение в геологический музей Российской академии наук в Москве. Он основан в 1988 году путём слияния двух музеев, один из которых возник более 200 лет назад при Московском университете. Известно, что первая партия минералов поступила в коллекцию музея в 1755 году от промышленников Демидовых.
Исхак Фархутдинов в последние несколько лет был последовательным противником передачи в разработку башкирских шиханов. Его аргументы в пользу их геологической уникальности стали одними из ключевых в ходе формирования общественного мнения жителей республики.
