Для того, что бы ответить на Ваш вопрос, Вам необходимо уточнить, какого содержания Вы направляете работодателю и что от него требуете.
Ответ прокуратуры является правомерным, так как действительно ФЗ № 59 не распространяется на работодателей.
Однако, если у Вас с работодателем возник трудовой спор, в соответствии со ст. 392 ТК РФ работник имеет право обратиться в суд за разрешением