Митрополит московский и всея Руси автор посланий, грамот составитель и инициатор ряда крупных книжных сводов. Информация про митрополита рассыпана по многим источником и ее крайне мало, кроме его последних 3х месяцев его жизни, которые описаны будущим всероссийским митрополитом Афанасьевым в Сказании о последних днях митрополита Макария, также информация о жизни содержится и в его ,,Прощальной грамоте”, которая завершает сказание о последних днях.
Деятельность митрополита можно разделить на 4 этапа:
1) Начальный – период пребывания в Пафнутиево-Боровском монастыре
2) Три года архимандрит можайского Лужецкого монастыря
3) Архиепископство в Новгороде и Пскове
4) Всероссийский митрополит
Во время архиепископства в Новгороде митрополит поддерживал великого князя Василия 3 в его борьбе с удельными князьями, также Макарий способствовал усилению влияния Москвы. Ввел в 1528 году в монастырях Новгорода общежитейский устав, разграничил женские и мужские монастыри и прочие. Об этом он пишет Василию 3 в своем послании и игумену Духова монастыря Тихону в Уставной грамоте.
При Макарии была проведена реставрация многих церквей и икон Новгорода, также был отлит колокол для кафедрального Софийского собора. В 1535 году по указанию Макария был построен архиепископский дворец во Пскове. В период архиепископства в Новгороде развернулась его редакторская, литературная и книгописная деятельность. В 1539 был составлен Владычный свод Макария, который продолжил Летопись Новгородскую IV и владычный свод архиепископа Евфимия. В 1540 году вместе с Агафоном М. составил ,,Великий миротворный круг”, в котором пасхалия была на 532 года вперед.
В 1542 году Макарий был поставлен митрополитом Московским и ,,всея Руси”. Митрополит занял при Иване Грозном положение царского советника, который участвовал в решение государственных проблем. С его назначением усилилась роль ,,иосифлянской” группировки, которую поддерживал Савва Крутицкий, Новгородский архиепископ Феодосий, рязанский и муромский епископ Леонид
После прихода к правлению в конце 1549 года Избранной рады, которая поддерживала секуляризационную политику правительства, между Макарием и Иваном Грозным произошел обмен посланиями по спорному вопросу о митрополичьих и монастырских слободах, а в 1550 году в ,,Ответном послании” царю о ,,святительском суде” и о владении церкви недвижимым имуществом митрополит сделал попытку документально обосновать право церкви на землевладение.
В этом споре «иосифлян» с «нестяжателями» верх одержала группировка Макария, оказавшаяся в большинстве на Стоглавом соборе, состоявшемся в 1551 году. Решение собора, которое содержало ответы церковников на вопросы царя, было оформлено как уставной сборник из ста глав — Стоглав. Вопрос о степени участия М. в составлении Стоглава спорный; А. А. Зимин считает, что М. принимал участие в составлении только ответов царю, а в ряде глав Стоглава (гл. 3, 33, 35, 60, 62, 63, 75) лишь использованы его послания, грамоты и указы.
Деятельность М. в 1552—1555 гг. связана с победным походом Ивана Грозного на Казанское царство (в это время царь оставлял митрополита в столице вместо себя). 1552 году два послания Макария царю и боярам, которые содержали призывы к единению подданных под властью самодержца для победы над врагами. В 1555 году митрополит провел церковный собор, на котором была образована новая Казанская епархия, а 3 февраля участвовал в поставлении первого казанского архиепископа Гурия. При поддержке Макария создаются в эти годы грандиозные, пышные памятники архитектуры и литературы, в которых прославляется величие и сила русского самодержца.
С середины 1550-х гг. происходит постепенное отдаление Макария от правительственных дел. Во время болезни царя в 1553 году Макарий не поддержал ни Дмитрия, ни Владимира Андреевича Старицкого. В 1560 году участвовал в соборе, который осудил Адашева и Сильвестра, он пытался воспользоваться правом ,,печалования”, и просил вызвать для участие в соборе обвиняемых, но получил отказ от Ивана Грозного
В последние годы жизни, начиная с 1560 г., М. руководил работой над Степенной книгой, создаваемой по его инициативе Афанасием. Деятельность Макария создателя, как инициатора, и редактора многих книжных сводов, которые были признаны впоследствии своеобразными «энциклопедиями» XVI в., и возглавляемая им работа по изучению, собиранию и организации массовой многократной переписки накопленного веками рукописного наследия заметно стимулировали развитие книгописных центров и в городах (Новгороде, Москве, Пскове и др.), и в монастырях, а его самого побудили способствовать открытию русской типографии (до выпуска первой печатной книги в 1564 г. он лишь немного не дожил).
Макарий умер ночью 31 декабря 1563 года и был похоронен в Успенском соборе. Макарий не был канонизирован он занесен в списки русских святых ,,не почитаемых”