Хозирги Коракалпогистон худудида жуда куп асрлик тарихга эга саналиб бу ерда одамлар сунгги палеолит давридан яшай бошлаганлиги тарихий ва археологик казишмалар натижасида топилган манбалар асосида исботланган. Милоддан аввалги 5 минг йиллик — 2 минг йиллик бошларида бу ерда яшаган ахоли асосан, Амударё делтаси ва Орол, Каспий денгизлари ён атрофларидаги чулларга ейилган холда хает кечиришган. Милоддан аввалги 2 минг йиллик охирида бу худудда яъни Коракалпогистон худудида сугорма дехкончилик пайдо булган. Бу эса уз навбатида коракалпокларнинг хужалик хаетидаги улкан узгаришлара имкон яратиб берди. Милоддан аввалги 7 — 6 асрларда Коракалпогистон худудида кадимги давлатчилик марказлари юзага келган. Бирок эрон ахамонийларининг мустамлакачилик сиесати бу худудни уларнинг ихтиерига утиши билан хотима топади. Тарихдан маълумки милоддан аввалги 4 асрда кадимги Хоразм давлати ташкил топди. Куйкирилган-калъа, Ойбугир ва Бурликалъа шахарлари харобаларини казиш вактида топилган кадимги ёзма ёдгорликлар ( милоддан аввалги 4 - асрга оид ), Куйкирилганкалъа ва Окшохонкалъадан топилган кадимги тасвирий санъат ва хайкалтарошлик ёдгорликлари коракалпогистон худудининг утмиш тарихини тилсиз гувохларидир.
Ушбу худудда жойлашган ва милодий 3 — 4-аср бошларига оид булган Хоразмшохларнинг Тупроккалъа саройи сунгги антик даврнинг энг улкан ёдгорликларидан бири хисобланади. 8 асрда арабларнинг Урта Осиега кириб келиши натижасида илгари шу худудда хукм сурган зардуштийлик акидалари сикиб чикарилади. 12 — 13 асрларда буюк Хоразмшохлар давлати Гарбий Осиё ва Урта Шаркда энг йирик ва кучли давлат эди. 13 асрда мугуллар истилосидан сунг эса мазкур давлат парчаланиб кетади. 14 асрда Хоразм Олтин Урданинг энг бой ва маданий вилоятига айланди. Айнан шу Хоразмшохлар даврида Коракалпогистон худудидан Осиёдаги кушни мамлакатлар, Дашти Кипчок ва Волга буйига мухим савдо йуллари утган ва бу йул халкаро савдода мухим ахамиятга эга булган. Коракалпокларнинг энг кадимги этногенези Амударё делтаси ва Орол Каспий буйи чулларида милоддан аввалги 7 — 4-асрларда яшаган сак-массагет кабилалари билан боглик. 6 — 8-асрларда махаллий ахоли билан туркий кабилаларнинг кисман аралашуви содир булади. 8 — 10 асрларда бижанак ва угизлар мухитида коракалпок миллати шакллана бошлади.
Чингизхоннинг боскинчилик юришлари музкур худудни хакикий чулга айлантирган, бу эса уз навбатида табийки Амударёнинг куйи окими атрофларида яшаган ахолининг кучиб кетишига сабаб булган. Айнан уша пайтда Коракалпоклар гарбга Узбуй, Волга ва Урал томонга кучиб утганлар. У ерда эса Олтин Урда таркибида булганлар. Коракалпоклар Рашидуддин асарида " кавми кулохи сиёх " номи ила тилга олинади. Коракалпокларнинг аксарият кисми 17 — 18 асрнинг урталарида Сирдарёнинг урта ва куйи окимларида яшаган. 18 асрнинг урталаридаги сиёсий вокеалар, яъни козок хони Абулхайрхоннинг коракалпок ерларига хужум килиши окибатида улар Сирдарё делтасидаги гарбий тармоги — Жанадарё буйларига кучиб утадилар ва Амударёнинг куйи окимида яшовчи коракалпоклар орол узбеклари билан бирлашиб, маркази дастлаб Кунгирот, сунгра Шохтемир ( хозирги Чимбой ) булган давлат Орол мулкини тузадилар. Бу пайтда эса коракалпоклар асосан, чорвачилик, дехкончилик ва жойлашувдан келиб чикиб баликчилик биллан шугулланганлар.