Если при перевозке агент выступает от имени принципала-перевозчика, то обязанность составлять и выставлять контрагентам-заказчикам счета-фактуры ложится непосредственно на него. Такие разъяснения дает Минфин в письме от 28.04.2018 № 03-07-09/29386.
В посреднических сделках агент, как правило, выступает от своего имени. Но иногда стороны могут заключить такой договор, в котором посредник действует от имени принципала. От того, как именно будет заключен договор, зависит то, кому из сторон придется составлять для покупателей счета-фактуры.
В Правилах заполнения счетов-фактур записаны особенности для документов только в случае, когда агент выступает от своего имени. А особенностей по подготовке счетов-фактур, если он выступает от имени перевозчика, они не устанавливают. Значит, в такой ситуации применяется общий порядок, когда счет-фактуру оформляет тот, кто фактически оказывает услугу (а это принципал).
Посреднику здесь не придется ни составлять счет-фактуру на оказанные услуги, ни фиксировать в своем журнале учета счетов-фактур документ, который был составлен принципалом. Ведь в данном журнале надлежит учитывать только те счета-фактуры, которые сам же агент составляет либо получает.