Храм Иоана Предтечи в Керчи,по версии исследователей,был возведен на месте древней церкви,которую в первом веке основал апостол Андрей Первозванный,существует даже легенда,что где то здесь есть плита с отпечатком следа апостола.Точное время возведения храма неизвестно,но судя по надписи найденной на одной из колонн,в которой говорится,что в этой церкви в 752 году был захоронен неизветный сын Георгия,то время постройки можно отнести к 8-9 веку,об этом так же свидетельствуют найденные в кладке стен древние греческие амфоры,которые замуровывались туда для лучшего звукового эффекта.Во времена генуэзцев,храм был настолько почитаем,что Керчь и пролив в народе называли,Иоанов порт и Иоанов пролив и скорее всего в тоже время были созданы фрески украшающие храм.Незавидная участь настигла храм во время заселения полуострова турками,церковь Иоана Предтечи,как р многие другие,переделали в мечеть и только с 1774 года,после подписания мирного договора и вхождении Крыма в Российскую империю,церковь стала называться греческой и снова обрела статус православной.Ещё один непростой период был в1930-х годах,когда церковь,как впрочем и многие другие закрыли.В 1963 году храм был признан памятником архитектуры,постепенно начались работы по восстановлению и реставрации.
В данное время церковь Иоана Предтечи действующая,здесь проводятся службы и обряды,место очень популярное среди верующих,и туристов желающих увидеть и прикоснуться к этой святыне православия.