Серж Саргсян возглавлял "карабахский" клан, который с марта 1997 года взял под контроль все силовые структуры Армении, а с февраля 1998 года стал полностью управлять Арменией. Представителями "Карабахского клана" были президенты Роберт Кочерян и Серж Саргсян. При "карабахце" Кочеряне в 1999 году в результате теракта в парламенте были убиты 8 политиков , составлявших оппозицию клану- председатель Национального собрания Карен Демирчян, премьер-министр Вазген Саркисян, вице-спикеры Юрий Бахшян и Рубен Мироян, министр по оперативным вопросам Леонард Петросян, депутаты Арменак Арменакян, Микаэл Котанян, Генрих Абрамян. Тандем Демирчян – Саркисян обрел тогда большую власть: первый стал спикером парламентом, второй – премьер-министром. Многие в Армении помнят, что брат Сержа Саргсяна – Сашик Саргсян однажды сказал: «Мы стольких людей в парламенте не для того положили, чтобы сегодня вот так просто отдать власть другим». Этот эпизод имел место за несколько месяцев до президентских выборов