Цвет воды в естественных водоемах определяется составом горных пород, из которых сформированы речные водосборы, с одной стороны, и поступлением окрашенных органических веществ — с другой. Речная вода (особенно если река горная) чаще всего бесцветная или прозрачная. Это обусловлено как притоком подземных вод, так и подпиткой реки за счет таяния ледников и снежников, а также строением русла из трудно размываемых пород: гранита, базальта. Когда в условиях бурных потоков вода оказывается перенасыщенной пузырьками воздуха, кажется, что по рекам течет молоко, до такой степени вода непрозрачна. Бирюзовый цвет воде придают горные породы и ледниковое питание в сочетании с насыщенностью воды кислородом. Такое можно наблюдать, например, в реке Катунь в районе Горно-Алтайска. Наличие взвешенных частиц (зола, пыль, сажа и т. п.) может придавать воде желтый или бурый оттенок (как на реке Хуанхэ или нашей Кубани). Зачастую бурый оттенок имеют воды рек и ручьев, текущих из болот — это обусловлено п