27 марта 2018 года Яндекс выпустил новую версию ответвления приложения Яндекс Диск 3.0 которая соединяет в себе версии 2.0 и 1.0. Во второй версии была реализована возможность удаленного доступа к данным через приложения без использования браузера, без хранения данных на локальном диске как в первой версии. Новый Диск 3.0 соединяет разошедшиеся ветви 1.0 и 2.0 совмещает их преимущества.
В третьей версии стала доступна выборочная синхронизация файлов при которой можно продублировать необходимые в оффлайн документы, а все что нужно хранить в облаке будет доступно при наличии интернета в этом же окне. В нижнем правом углу каждого файла теперь располагаются иконки показывающие где сохранен файл в данный момент и дана ли на него ссылка.
Для пользователей ОС Windows стали доступны заметки, плюс голосовые заметки на основе Yandex SpeechKit которые можно надиктовать, а программа переведет их в напечатанный текст.
