В этом доме в 1909-1912 годах отбывал политическую ссылку Иосиф Джугашвили (впоследствии Сталин). На протяжении долгого времени в Вологодский край, «подстоличную Сибирь», ссылали высокопоставленных особ и революционеров. Среди заключённых здесь был и патриарх Никон. После реформ 1860-х годов количество ссыльных стало быстро увеличиваться. Здесь отбывали наказание народники, социал-демократы. К началу 1903 года под гласным полицейским надзором в Вологде жили будущий нарком просвещения РСФСР Анатолий Луначарский, революционер Борис Савинков, философ Николай Бердяев и другие. Вторая волна ссыльных датируется 1907-1910 годами, когда первая русская революция потерпела поражение. В Вологде в этот период жили уже упомянутый Сталин, Вячеслав Молотов, Мария Ульянова (сестра Владимира Ленина). В музее представлены документы об органах политического сыска, местных тюрьмах и знаменитых «посетителях». В отдельной части расположена комната Иосифа Джугашвили, основным экспонатом которой является его