Даже если документ с выделенной суммой налога был выставлен по освобожденной от НДС операции.
Источник: Определение ВС от 27.11.2017 № 307-КГ17-12461 (http://www.consultant.ru/cons/cgi/online.cgi?req=doc&base=ARB&n=520313#0)
Как отмечается в недавно вынесенном определении Верховного суда, обязанность продавца уплатить НДС в бюджет и право покупателя принять налог к вычету связаны с одним и тем же фактом – выставлением счета-фактуры с выделенной суммой налога. Поэтому, даже если такой счет-фактура выставляется неплательщиком НДС или плательщиком налога, но по реализации, не подлежащей обложению НДС, покупатель вправе применить налоговый вычет.
Кстати, Минфин и ФНС (http://glavkniga.ru//news/5893) считают также.
