Старославянский глагол «запти» имел значение «задержать, остановить». Он содержал в своем составе так называемый «юс малый» — особый носовой звук, чем-то напоминающий французский «in». Время шло, возникали новые слова, и в некоторых из них получилось звуковое сочетание местоимения «он» и гласной «я». Так образовались слова «перепонка» и «запятая», а также «запона» — в значении застежки или скрепки. Суффикс «-к» послужил образованию уменьшительной формы этого слова. Кстати, хомут на конской сбруе надлежало стягивать с помощью супони – вот вам еще одно слово того же корня.