Prototype – это оригинальный фантастический экшн, героем которого становится Алекс Мерсер, очнувшийся в морге и ничего не помнящий о своей прошлой жизни. Когда он выбирается наружу, то осознаёт, что наделён теперь сверхъестественными способностями и по силе и ловкости не уступает любому супергерою. Только теперь за Мерсером охотятся военные, а сам он не помнит, почему стал таким. На улицах Манхеттена, где разворачивается действие, бродят мутанты и кровожадные зомби, но они не в силах остановить нашего героя.
Главной способностью персонажа, которым предстоит управлять игроку, является поглощение чужой памяти и опыта. И чтобы вернуть память, Мерсеру придётся проникать в головы других людей, собирая информацию, как части головоломки, которая сложится в единое целое только в конце игры. Помимо памяти и опыта с убийством каждого живого существа ему предоставляется возможность принимать его облик.
Герой действительно неудержим благодаря своим способностям и лишь игроку выбирать, проникнет