В последнее время предсказание клинических результатов лечения онкологических пациентов на основании экспрессии маркерных генов в образцах опухолей таких пациентов получило широкое распространение.
Возможность осуществлять качественное предсказание результатов лечения, а также реакции пациентов на проводимое лечение может использоваться для персонализации онкологического лечения, что в следствии должно привести к улучшению качества лечения в целом. Однако, в настоящее время данный подход имеет ряд ограничений, например, воспроизводимость экспрессии таргетного гена, ограниченная возможность предсказания на основании получения результатов и невозможность привязки данного анализа к биологической функции того или иного гена.
Для решения вышеперечисленных проблем, ученые из компании Google разработали новую компьютерную программу, которая способна интегрировать полученные данные экспрессии генов из образца опухоли с данными о взаимодействиях изучаемых генов с другими генами.
Ученые использовали такой подход для анализа образцов 30 пациентов с опухолью поджелудочной железы и идентифицировали 7 потенциальных генов.
Подтверждение данного метода была проведена с применением иммуногистохимического метода и с использованием 412 независимых образцов опухоли поджелудочной железы. Иммуногистохимические данные подтвердили достоверность данных полученных с помощью компьютерного подхода, и выявили, что качество получаемых данных улучшается на 7% по сравнению с ранее созданными компьютерными аналогами.