В 2012 году, спустя 3 года после выхода первой части игры, "Radical Entertainment" презентует вторую главу для консолей PS3, Xbox 360, спустя еще три года появляется версия для Xbox One и PS4.
Продолжение разочаровало многих фанатов не вызвав столь высокого интереса как первая часть, но есть и те кто до сих пор ждет выпуск "Прототип 3".
Основной причиной, по которой разработчики решили не продолжать проект стали финансовые трудности возникшие из-за низких продаж игры.
В июне 2012 года представители компании заявили о закрытии Radical Entertainment, а серию видео игр Prototype объявили провалом с комерческой точки зрения.
Activision Blizzard не видит перспектив для дальнейшего развития Radical, и прекратило помощь разработчикам расформировав студию, а сотрудников распределили по другим подразделениям.
Ранее, дата выхода Prototype 3 должна была быть известнак 2014 году, т.к. Activision хотели выпустить третью часть мясного экшена на уже теперешнем поколении консолей, т.е. Xbox One и PlayStation 4. Однако, на дворе уже 2017 год, а никаких сведений о Prototype 3, а уж тем более такой информации, дата выхода Prototype 3, попросту нет. Фанаты находятся в ожидании все это время и надеются, что Activision не соврали и сейчас они заняты разработкой новой части. Возможно, что уже в скором времени мы услышим новые подробности о Prototype 3.