Будучи выходцем из королевского клана, теоретически Дауд-хан имел права на престол, однако ограничился постом президента. В благодарность за помощь в проведении переворота члены «Парчам» заняли ключевые посты в правительстве, а Кармаль стал неофициальным главным советником президента.
После свержения Захир-шаха исламисты обратились к Дауд-хану с предложением о сотрудничестве. Однако они поставили президенту обязательное условие – отстранение от власти всех членом НДПА. В ответ Дауд арестовал Ниязи, после чего лидеры исламского движения спешно покинули страну. Если члены «Мусульманской молодежи» эмигрировали в Пакистан, то Себгатулла Муджадиди удалился в Данию, где создал исламский центр.
В эмиграции «Мусульманская молодежь» сразу же раскололась на две фракции: Джамат-и- Ислами (Исламкое общество) во главе с Раббани и Хизб-и Ислами (Исламская партия), которую возглавил Хекматиар. Последние выступали за немедленную организацию исламского восстания против режима Дауда, тогда как Раббани придерживался более реалистичной тактики выжидания.
В 1975 г. Хекматиару удалось создать в Афганистане сеть отрядов, которые подняли восстание в Панджшерской долине, провинциях Пактия, Бадахшан и Логар. Дауду удалось довольно быстро подавить выступление исламистов, после чего по его приказу в тюрьме был убит Ниязи. Только в Панджшере, где сопротивление возглавил таджик Ахмад Шах Масуд, власти не смогли справиться с повстанцами.
В том же году Дауд-хан издал закон о земельной реформе. Был установлен допустимый максимальный размера земельного участка, а все излишки выкупались государством в рассрочкой на 25 лет и передавались, так же в рассрочку на этот же срок безземельным и малоземельным крестьянам. Однако, это закон не выполнялся и прекратился в пустую декларацию.
Расправившись с исламистами, Дауд-хан принялся за своих союзников из Парчама. Он начал направлять крупных чиновников-парчамистов в дипломатические представительства, удаляя их таким образом из Афганистана. После этого Дауд попытался избавиться от сильнейшей экономической зависимости страны от советской финансовой помощи. Во время правления Захир-шаха СССР оставался основным финансовым донором Афганистана, вкладывая в развитие экономики сртаны сотни миллионов долларов.
Теперь же Дауд-хан начал переговоры с иранским шахом о строительстве железной дороги из Кабула к портам Персидского залива. Подобная магистраль сломала бы транспортную монополию СССР, поскольку единственной современной трассой, связывавшей Афганистан с внешнем миров, по-прежнему оставалось шоссе на Термез. Тегеран с готовностью согласился профинансировать строительство железной дороги, предложив Дауду кредит размером в 2 млн. долларов на 10 лет. Одновременно Кабул старался нормализовать отношения с Пакистаном и Китаем.
Подобная политика вызвала сильнейшее раздражение в Москве. В 1977 г. во время визита президента Дауд-хана в Москву у него состоялся крайне неприятный разговор с Брежневым, после чего советское руководство приняло решение организовать в Афганистане еще одни переворот. К тому времени Дауд сформировал новое правительство, целиком состоявшее из членов королевского клана и их клиентов. Фактически это означало полное отстранение НДПА от власти.