После подписания Хасавюртовского соглашения, российские власти планировали вернуться к решению чеченского вопроса к 2001-му году. Теперь лидером республики был Аслан Масхадов, беспредел 90-х годов вернулся с новой силой.
Мало того, что в Чечне процветала торговля наркотиками и оружием, силу набирала и несанкционированная нефтедобыча. Утилизацией отходов никто не занимался. Остальным нефтедобывающим странам такое положение дел было выгодным – Россия не могла экспортировать каспийскую нефть.
К тому же, сепаратисты привлекли на свою сторону запрещенные террористические организации – Аль-Каиду и Талибан. Совместно они готовили все новые теракты.
Перед тем, как ввести войска в Дагестан, отряды чеченцев совершили примерно 30 набегов, результатом которых стали крупные террористические акты в Москве, Волгодонске и Буйнакске. Руководство Чеченской республики смотрело на действия боевиков сквозь пальцы. Именно тогда московские власти решили предпринимать активные действия.
Нельзя было медлить – боевики уже в Дагестане. Да и российская армия набралась опыта и сил. При таком развитии событий военные действия на дагестанской территории велись чуть больше месяца – с 7 августа 1999-го года до 14-го сентября.
Позже подключились и силы авиации. К началу декабря боевики занимали Грозный и горные районы. С 26-го декабря начался штурм столицы, пал Грозный 6 февраля.
Через месяц было объявлено о завершении масштабной войны, теперь российские военные проводили локальные спецоперации против партизанских отрядов боевиков.
В высший кругах правительства Ичкерии начался раскол, некоторые руководители приняли позицию России. В результате военных операций были убиты несколько командиров террористов, среди них – приближенные к Хаттабу и Шамилю Басаеву.
Весной 2000-го года активные военные действия прекращаются, иногда федеральным силам приходилось держать оборону Грозного и штурмовать небольшие населенные пункты.
Режим контртеррористической операции был снят лишь спустя девять лет. По официальным подсчетам, потери российской армии составили 4,5 тысячи человек погибшими и 15,5 тысяч были ранены. Боевики потеряли около 14 тысячи солдат.