Налоговый агент по НДФЛ обязан перечислять удержанный налог в инспекцию по месту своего учета. Однако если у организации есть обособленное подразделение, НДФЛ с выплат работникам подразделения необходимо уплатить в инспекцию по месту его нахождения. Не имеет значения, выделено оно на отдельный баланс или нет.
Обособленное подразделение – это любое территориально обособленное от организации подразделение, по месту нахождения которого оборудованы стационарные рабочие места, т.е. места, созданные на срок свыше одного месяца.
Понятие рабочего места закреплено в Трудовом кодексе РФ (ст. 209 ТК РФ). При этом ТК РФ не регулирует отношения, возникающие на основании гражданско-правовых договоров (договоры подряда, возмездного оказания услуг и т.п.). Если с физлицом оформлен договор оказания услуг, рабочего места у него не возникает. Соответственно, это не приводит к образованию обособленного подразделения.
Таким образом, НДФЛ с вознаграждения исполнителя по ГПД необходимо перечислить в налоговый орган по месту учета организации - заказчика услуг.