В настоящее время применяются три вида сканирования мозга: АКТ, или КТ (аксиальная компьютерная томография), МРТ (магнитно-резонанская томография) и ПЭТ (позитрон-эмиссионная томография). В основе этих методов разные физические процессы, и поэтому их использование имеет небольшие различия. Каждый метод позволяет получать двухмерные изображения мозга в виде серий «срезов», напоминающих ломтики нарезанного помидора. АКТ представляет физическую структуру мозга и может отображать детали размером 1—2 мм в ширину. Сканирование МРТ делает то же самое, но позволяет видеть кровоток, и этот метод можно использовать «функционально». Например, при движении руки или ноги особые «последовательности» МРТ отмечают увеличение притока крови к областям мозга, ответственным за движение. МРТ не может отражать непосредственно сами мысли, но возможна регистрация увеличения притока крови к «речевым областям» мозга, стимулированное чтением и письмом. Сканирование ПЭТ используется приблизительно таким же образ