В 1337 году Варфоломей (будущий преподобный Сергий Радонежский) и его старший брат, Стефан, инок хотьковского Покровского монастыря, поселились на холме Маковец, в 10 верстах от Хотькова. Это событие считается датой основания Троице-Сергиевой пустыни. Только в 1744 году монастырь получил почетный титул лавры.
На протяжении столетий Троице-Сергиева лавра является одной из самых почитаемых общерусских святынь, крупнейшим центром духовного просвещения и культуры. В лавре веками собиралась уникальная библиотека рукописных и старопечатных книг. Постриженниками лавры основаны и духовно обустроены сотни русских монастырей. В 1608–1610 годах обитель выдержала осаду 30-тысячного войска польско-литовских интервентов (осажденных в самом монастыре насчитывалось около 3 тысяч).
В XVIII–XIX веках в окрестностях лавры возникли Вифанский монастырь, Боголюбский, Черниговско-Гефсиманский скиты и скит Параклит. Эти небольшие обители, духовно и административно связанные с лаврой, явили миру замечательных старцев-подвижников.
С 1814 года на территории Троице-Сергиевой лавры располагается Московская духовная академия — старейшее высшее учебное заведение России, основанное в 1685 году в Москве. Переведенная после пожара 1812 года в лавру академия разместилась в бывших Царских чертогах. В 1920 году Троице-Сергиева лавра была закрыта, в ее зданиях разместились Историко-художественный музей и другие учреждения, часть строений заняли под жилье. Возрождение обители началось в 1946 году.